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書誌情報

書名

実践バイオインフォマティクス ゲノム研究のためのコンピュータスキル    

著者名 Cynthia Gibas/著   Per Jambeck/著   水島 洋/監修・訳   明石 浩史/訳   またぬき/訳
出版者 オライリー・ジャパン
出版年月 2002.1


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No. 所蔵館 資料番号 請求記号 配架場所 所蔵棚番号 資料種別 帯出区分 状態 付録 貸出
1 中央図書館0116021312467.3/ギ/書庫3一般図書一般貸出在庫  

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Cynthia Gibas Per Jambeck 水島 洋 明石 浩史 またぬき
2002
467.3 467.3

書誌詳細

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タイトルコード 1001001326330
書誌種別 図書
書名 実践バイオインフォマティクス ゲノム研究のためのコンピュータスキル    
書名ヨミ ジッセン バイオインフォマティクス 
著者名 Cynthia Gibas/著
著者名ヨミ Cynthia Gibas
著者名 Per Jambeck/著
著者名ヨミ Per Jambeck
著者名 水島 洋/監修・訳
著者名ヨミ ミズシマ ヒロシ
出版者 オライリー・ジャパン
出版年月 2002.1
ページ数 427p
大きさ 24cm
分類記号 467.3
分類記号 467.3
ISBN 4-87311-068-8
内容紹介 生物的なコンピュータを使ったアプローチとして、ツールデータベースの作り方、UnixファイルシステムやPerlの簡便さの紹介、そしてデータの構築方法や、そのデータの視覚化といった広範囲の内容を解説する。
著者紹介 バージニア工科大学生物学部助教授。コンピュータ生物学者。
件名 バイオインフォマティクス
言語区分 日本語
書評掲載紙 朝日新聞

(他の紹介)内容紹介 ポストシークエンス技術やゲノム研究において、もはやコンピュータのサポートなしでの作業は考えられない。本書は、ゲノム研究の最前線で有用なソフトウェアやデータベースの活用法を実践的なアプローチで解説する。Linuxマシンのインストール方法や便利なコマンドの解説に始まり、実際のデータ解析や研究課題に沿った形で、データベースや関連ウェブサイトを紹介し、解析ソフトウェア、データベースシステムなどの機能や使い方を詳しく掘り下げる。
(他の紹介)目次 1部 序章(コンピュータ時代の生物学
生物学的問題のコンピュータ的解法)
2部 ワークステーション―システム環境(ワークステーションのセットアップ
Unixのファイルとディレクトリ ほか)
3部 作業ツール群(生物学研究に役立つウェブ
シークエンス解析、ペアワイズアラインメント、データベースサーチ ほか)
4部 データベースおよび視覚化(Perlを用いてデータ解析を自動化する
生物学データベースを構築する ほか)
(他の紹介)著者紹介 ギバス,シンシア
 バージニア工科大学生物学部助教授。コンピュータによる生物学が盛んになる以前からのコンピュータ生物学者である。最近では、作ったばかりの自家製Linuxクラスターを動かすことを勉強中。専攻は、ゲノム構造、ゲノム進化、タンパク質の表層や接触面の特性、タンパク質構造の予測などの研究である。現在は、生物学者向けのバイオインフォマティクス入門コースを教えている(本データはこの書籍が刊行された当時に掲載されていたものです)
ジャンベック,パー
 カリフォルニア州立大学サンディエゴ校生物工学部学生。博士。1994年からコンピュータ生物学問題に従事し、多次元の生物学データを識別するアプリケーションを学びつつマシンに向かっている(本データはこの書籍が刊行された当時に掲載されていたものです)
水島 洋
 専門は、バイオインフォマティクス、分子生物学、医療情報学、東大薬学部では酵素精製とクローニング(配列解析はMaxam‐Gilbert法)、国立がんセンターではウィルス感染による宿主遺伝子の発現変化の研究を行った後、医療施設間ネットワークとスーパーコンピュータプロジェクトに従事。バーチャルリアリティを用いた分子モデリングなども行っている。主たる研究はゲノム情報の発現制御システムの解明。2000年8月より客員研究員としてNCBIに留学。疾病ゲノムセンター併任(本データはこの書籍が刊行された当時に掲載されていたものです)
明石 浩史
 専門は分子生物学、消化器内科学と医療情報学。札幌医科大学大学院で4年間、東京大学医科学研究所で2年間、遺伝子ハンティングを中心とした分子生物学の研究に従事し、その中でバイオインフォマティクスの重要性、必要性を痛感した。現在札幌医大附属情報センターにてオリジナルのゲノムシークエンス解析ツールの開発に従事している(本データはこの書籍が刊行された当時に掲載されていたものです)
またぬき
 医師であり、Linux kenrelやIPv6のハッカーでもある。Debian‐JPプロジェクト、Debianプロジェクトに所属。LinuxのIPv6機能をサポートするUSAGI projectにnetfilterv6のlogging機能の修正を提供している。また、ネットニュースサーバINNのIPv6化においてハッカー、テスターとして貢献している。Linux関係のドキュメントではJFの「Linux Medicine HowTo」の日本語訳に助言を与えた。Debianパッケージ「ipv6calc」のメンテナでもある。日本学術振興会産学協力委員会インターネット技術第163委員会(ITRC)では第10回研究会のprogram conductorを勤めた(本データはこの書籍が刊行された当時に掲載されていたものです)


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